Els projectes interns desenvolupats en col·laboració amb múltiples centres han estat finançats majoritàriament amb recursos propis d'ESTEVE, als quals s'han afegit ajudes públiques competitives. ESTEVE no ha sol·licitat ni rebut mai finançament d'associacions de pacients ni particulars.
E-52862 ha tingut ajuda per part del Ministeri d'Economia i Competitivitat, a través del Centre per al Desenvolupament Tecnològic Industrial (CDTI) per a la validació clínica en dolor neuropàtic, així com els projectes Multimodal-1, Multimodal 2, Multimodal 3, Multimodal 5 i Sigma-1 noves indicacions, que també han estat cofinançats per la Unió Europea a través del Fons Europeu de Desenvolupament Regional (FEDER).
El projecte E-58425 ha tingut una ajuda concedida per l'Agència de Competitivitat de l'Empresa (ACC1Ó) de la Generalitat de Catalunya en el marc de la línia de préstecs a projectes d'innovació industrial i desenvolupament experimental a través de l'ICF (Institut Català de Finances).
El projecte Sanfilippo ha tingut ajudes amb càrrecs al pressupost de despeses del Ministeri d'Economia i Competitivitat i al Ministeri de Sanitat, Política Social i Igualtat en convocatòries competitives del Govern d'Espanya per a projectes de recerca, en les quals el projecte va ser reconegut per la seva excel·lència científica.
El projecte Phenopain (Desenvolupament de Models Fenotípics In vitro de Dolor i la seva Aplicació al Cribratge de Compostos d'Alt Rendiment) té com objectivo la generació de models translacionals in vitro per a la seva aplicació a descobriment de fàrmacs per a predir el perfil terapèutic de nous fàrmacs en dolor.
Phenopain ha rebut finançament de programa REPTES-COL·LABORACIÓ del Ministeri d'Economia i Competitivitat i ha estat cofinançat per la Unió Europea a través del Fons Europea de Desenvolupament Regional (FEDER).